请问有独立于浏览器的本地收藏夹工具吗?

你这种思路可以看下这个开源程序,我觉得可以优化你的流程。
https://github.com/osmoscraft/osmosmemo
把GitHub变成书签存储库,同样是存储成你图中的样式

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iOS 的话可以试一下 Marklist,很好用

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找到满足楼主基本需求的了:QOwnNotes。在chrome和Firefox上都有插件,可以添加tag进行分类。以markdown文件保存在本地。插件还可以读取其他md文件内的网址。