感谢各位，问题已基本解决。总结一下：
- Zotero保存快照前，可以用16、17楼的办法先移除元素再保存。16楼的小书签优点是可以连续操作，小问题是有些跳转链接点击移除的时候会触发跳转；17楼ublock临时移除模式不会触发跳转，可以两者结合用。
- 对于已经保存的本地页面，方法1：用chrome的Print Edit WE、Save Page WE插件。打开两个插件“允许访问文件网址”设置就可以处理本地html文件，Print Edit WE插件操作起来比较简便，保存后要自己改名覆盖原文件。小问题是编辑后的文件可能比原文件还大。方法2：用2楼的方法，直接在chrome开发者工具中编辑，这个操作门槛有点高，好处是不会改变文件编码，删除元素后文件大小肯定是减小的。方法3：用19楼推荐的chrome浏览器Singlefile插件，也要设置“允许访问文件网址”。移除元素的操作也很方便，而且生成的新文件容量也变小，还支持批注。不过部分特殊页面处理效果和方便性不如Print Edit WE（也可能和我个人水平有限有关）。例如我有个内容在背景题图上悬浮滚动的网页，选中前面的内容块，用删除选中区域以外的元素功能，singlefile处理完内容还是在一片空白上悬浮滚动，Print Edit WE处理完就没有悬浮滚动的效果了（个人希望实现的效果）。两者可以都留着，首选用Singlefile插件处理，比较特殊的再用Print Edit WE试试。
补充：SinglefileZ插件我也试了试，操作同Singlefile。我简单试了几个页面，图片多的情况下，前者保存的文件比后者小，页面简单的话反而可能是后者小。但在浏览器里查看时前者保存的文件占内存更大。其中一个图稍多的页面，前者保存文件大概5.44MB，后者保存文件7.38MB，在chrome中同时打开，鼠标悬停在标签显示的内存用量，前者185MB，后者64.4MB）。
PS：之前我用方法2用文本编辑器打开Zotero保存的快照文件时，看到开头部分有“Page saved with SingleFile” ，原来Zotero快照就是用的Singlefile的技术。