【开源自荐】基诺米 Genomi|解读基因的AI智能体

软件名称

Genomi 基诺米

应用平台

Windows / macOS / Linux
支持 龙虾:lobster:,Claude Code、Codex、OpenCode、Hermes Agent 等 Agent 宿主环境

一步下载:

把下面这句话复制给你的智能体

请按照这里的说明安装并配置 Genomi:
https://raw.githubusercontent.com/exon-research/genomi/main/install.md

推荐类型

【开发者自荐】/【开源自荐】

一句简介

把任何的AI智能体变成一个个人 DNA / 遗传学研究助手。

应用简介

基诺米是一个开源的AI智能体环境,可以理解为给现有智能体安装的一套「基因组研究技能包」,覆盖了88个专业基因工具和30个权威数据库组成。

它不是一个新的基因检测,也不是把原始 DNA 文件直接丢进聊天窗口里让大模型猜答案。基诺米会把测序数据解析成本地可查询的数据库,然后让智能体通过变异检索、知识库、文献搜索、证据追踪等工具进行多步研究。

我们的目标是:让个人基因数据留在本地,同时让AI智能体能更严谨地回答遗传学相关问题,例如药物代谢、变异解释、家族遗传线索、文献更新等。

核心功能

本地优先:

  1. 原始DNA文件保存在本机;
  2. 解析后建立本地数据库;
  3. 智能体查询的是结构化索引,而不是直接读取整份原始文件;

智能体集成:

  1. 支持作为技能包接入 龙虾:lobster:,Claude Code、Codex、OpenCode、Hermes Agent 等;
  2. 可以在你已经熟悉的 Agent 环境中使用;
  3. 支持命令行工作流,适合开发者和研究人员。

证据驱动:

  1. 通过变异检索、知识库和文献检索辅助回答问题;
  2. 尽量给出引用和证据来源;
  3. 遇到证据不足时,会明确说“不确定”或“不能下结论”;
  4. 更适合做研究辅助,而不是生成静态消费级报告。

其他功能

药物基因组学研究:

  1. 可辅助分析 CYP450 等药物代谢相关基因;
  2. 支持多变异组合视角,而不是只看单个基因;
  3. 输出需结合文献和专业意见验证。

文献更新:

  1. 可围绕某个变异检索新近研究;
  2. 适合做定期文献查询;
  3. 对 VUS / rare variant 等不确定变异,可辅助整理已有证据。

个人研究问题:

  1. 可以围绕用户自己的问题进行假设驱动检索;
  2. 支持把候选通路、候选基因、排除理由整理出来;
  3. 更像一个会查资料的基因研究员。

地址

GitHub:
https://github.com/exon-research/genomi

官网:
https://www.genomiagent.com/blogs/introducing-genomi

一步下载:

把下面这句话复制给你的 agent:

请按照这里的说明安装并配置 Genomi:
https://raw.githubusercontent.com/exon-research/genomi/main/install.md

附言

做这个项目的原因很简单:基因数据太私人了,但现有工具要么是静态报告,要么需要把数据交给某个平台。

我们希望探索另一种方式:数据在你自己的机器上,智能体在你自己的环境里运行,基诺米只提供遗传学相关的工具、索引和工作流。这样既能保留本地隐私,也能让智能体真正围绕证据、文献和结构化数据做研究。